شهر نیویورک از زمان تأسیساش به عنوان یک پست تجاری هلندی در سال ۱۶۲۴ تا امروز، نقش محوری در درگیریهای نظامی و جنگهای آمریکا و جهان ایفا کرده است. این شهر که دروازه ورود میلیونها مهاجر و مرکز قدرت مالی و نظامی آمریکاست، بارها صحنه جنگ، اشغال و مقاومت بوده است.
در سال ۱۶۲۴، کمپانی هند غربی هلند فورت آمستردام را در نوک جنوبی منهتن تأسیس کرد. ده سال بعد، جنگ کیفت (Kieft's War) بین سالهای ۱۶۴۳ تا ۱۶۴۵ به رهبری ویلم کیفت، فرماندار مستعمره نیو ندرلند، به نسلکشی سیستماتیک قبیله لناپ منجر شد. کیفت دستور حمله به روستاهای لناپ و کشتار زنان و کودکان را صادر کرد. تخمین زده میشود که ۱,۱۰۰ بومی در این حملات کشته شدند. در سال ۱۶۶۴، ناوگان انگلیسی به بندر نیویورک حمله کرد و بدون شلیک یک گلوله، مستعمره را تصرف کرد. پیتر استویسانت، فرماندار هلندی، مجبور به تسلیم شد و شهر به افتخار دوک یورک به «نیویورک» تغییر نام داد. انگلیسیها بلافاصله استحکامات نظامی در منهتن پایینی ساختند.
شهر نیویورک مهمترین شهر استراتژیک در جنگ انقلاب آمریکا بود. در نبرد لانگ آیلند در اوت ۱۷۷۶، جرج واشنگتن با ۲۰،۰۰۰ سرباز در برابر ۳۲،۰۰۰ سرباز بریتانیایی به فرماندهی ژنرال ویلیام هاو شکست خورد. واشنگتن با عقبنشینی شبانه از طریق رودخانه ایست ریور موفق به نجات ارتش خود شد. از سپتامبر ۱۷۷۶ تا نوامبر ۱۷۸۳، بریتانیا شهر نیویورک را اشغال کرد و آن را به پایگاه اصلی نظامی خود در آمریکا تبدیل کرد. در جریان اشغال، آتشسوزی بزرگ نیویورک در سپتامبر ۱۷۷۶ یکچهارم شهر را نابود کرد که یکچهارم شهر را ویران کرد. بریتانیا شهر را به قلعهای نظامی تبدیل کرد و هزاران سرباز در خیابانها پادگان گرفتند. زندانیان آمریکایی در کشتیهای زندان در خلیج والابوت (بروکلین) در شرایط غیرانسانی نگهداری میشدند. از ۱۱,۰۰۰ زندانی، بیش از ۸,۰۰۰ نفر در اثر گرسنگی و بیماری جان باختند.
در جنگ داخلی آمریکا (۱۸۶۱–۱۸۶۵)، شهر نیویورک به دلیل روابط اقتصادی با جنوب بردهدار، عمیقاً تقسیم شده بود. بانکها و بازرگانان نیویورک از تجارت پنبه با جنوب سود میبردند. شورشهای خدمت اجباری نیویورک در ژوئیه ۱۸۶۳ به مدت پنج روز ادامه یافت و به بدترین شورش مدنی در تاریخ آمریکا تبدیل شد. جمعیت سفید خشمگین، که از خدمت اجباری معاف بودند، به محلههای سیاهنشین حمله کردند. آنها کودکان را در یتیمخانه رنگیها (Colored Orphan Asylum) به خیابان ریختند و ساختمان را به آتش کشیدند. دستکم ۱۲۰ نفر کشته و بیش از ۲,۰۰۰ نفر زخمی شدند. ارتش فدرال مجبور به اشغال شهر برای برقراری نظم شد.
در جنگ جهانی دوم، حیاط کشتیسازی نیروی دریایی بروکلین (Brooklyn Navy Yard) به بزرگترین کارخانه کشتیسازی در جهان تبدیل شد. بیش از ۷۰,۰۰۰ کارگر در این حیاط کار میکردند که یکسوم آنها سیاهپوست و زنان بودند. ناوهای یواساس میسوری، یواساس اینترپرایز و یواساس آریزونا در اینجا ساخته شدند. بندر نیویورک نقطه اصلی اعزام نیروهای آمریکایی به اروپا بود. بیش از ۳ میلیون سرباز از طریق بندر نیویورک به جبهههای جنگ اعزام شدند.
در ۱۱ سپتامبر ۲۰۰۱، ۱۹ تروریست القاعده دو هواپیما را به برجهای مرکز تجارت جهانی در منهتن پایینی کوبیدند. این حملات نزدیک به ۳,۰۰۰ نفر را کشت و برجها را به ویرانه تبدیل کرد. این رویداد مرکز تجارت جهانی را به یک قبرستان دستهجمعی تبدیل کرد. عملیات پاکسازی ۹ ماه طول کشید و هزاران امدادگر در معرض گرد و غبار سمی قرار گرفتند. پس از این حملات، NYPD یک دستگاه نظارتی عظیم علیه جوامع مسلمان ایجاد کرد و بودجه پلیس به شدت افزایش یافت. جنگ علیه ترور میلیاردها دلار به اقتصاد نظامی نیویورک تزریق کرد اما حقوق مدنی را نقض کرد.