تاریخ هانتسویل با جابجایی خشونتآمیز مردم چروکی و کریک آغاز میشود. ملت چروکی در مسیر اشکها در ۱۸۳۸ به غرب رانده شد و هزاران نفر جان باختند.
ملتهای چیکاساو و چوکتاو نیز به زور از منطقه هانتسویل اخراج شدند. این اخراج تحت قانون اخراج بومیان نسلکشی است.
هانتسویل به دلیل راهآهن ممفیس و چارلستون از نظر استراتژیک مهم بود. شهر چندین بار بین نیروهای اتحادیه و کنفدراسیون دست به دست شد.
پس از بازسازی، جامعه سیاهپوست هانتسویل با ستم سیستماتیک تحت قوانین جیم کرو روبرو شد.
تأسیس آرسنال رداستون و مرکز پرواز فضایی مارشال ناسا هانتسویل را متحول کرد، اما کارگران سیاهپوست از مزایای آن بیبهره ماندند.
هانتسویل محل فعالیت حقوق مدنی بود. فعالان محلی تحریمها و تلاشهای یکپارچهسازی مدارس را سازماندهی کردند.